Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Sh3bp1P55194 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Sh3bp1P55194 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms