Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm7910-201ENSMUST00000117896 835 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SftpdP50404 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms