Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm36996-201ENSMUST00000194466 250 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm44306-201ENSMUST00000203058 203 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm44764-202ENSMUST00000204912 671 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr664-202ENSMUST00000211596 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC122360.1-201ENSMUST00000217737 624 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC132384.1-201ENSMUST00000219908 1195 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC122774.1-201ENSMUST00000227703 762 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Pglyrp4-201ENSMUST00000047745 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 4933430I17Rik-201ENSMUST00000062145 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm29671-201ENSMUST00000189438 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
VdrP48281 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 4933408N05Rik-201ENSMUST00000139864 1584 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm12917-201ENSMUST00000119850 639 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm11676-201ENSMUST00000120443 490 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm8865-201ENSMUST00000125697 430 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm12064-201ENSMUST00000133819 533 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm14339-201ENSMUST00000146224 423 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 4930438E09Rik-201ENSMUST00000176841 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Mir7060-201ENSMUST00000183486 137 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 2310005E17Rik-201ENSMUST00000186644 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Ing5-203ENSMUST00000190476 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Ms4a10-203ENSMUST00000191343 862 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Kmt5a-212ENSMUST00000198451 1032 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm7482-201ENSMUST00000206446 505 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm17909-201ENSMUST00000207587 907 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm2649-201ENSMUST00000218825 610 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 AC167013.6-201ENSMUST00000226587 1067 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Ms4a10-201ENSMUST00000072748 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Vmn1r80-201ENSMUST00000075053 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Gm5614-201ENSMUST00000091097 318 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Bcl2a1d-201ENSMUST00000098486 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
VdrP48281 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.3 ms