Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm15286-201ENSMUST00000150623 743 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Eya3-203ENSMUST00000081726 5160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Grip1-210ENSMUST00000144825 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Sptan1-201ENSMUST00000046257 7820 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm5431-201ENSMUST00000109209 1701 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm28087-201ENSMUST00000189195 767 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Nedd1P33215 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms