Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Rnf170-ps-201ENSMUST00000181188 859 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Pabpc1P29341 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms