Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Grk3-201ENSMUST00000065167 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Cacna1f-202ENSMUST00000115726 6079 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Rnmt-201ENSMUST00000009679 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
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PtprmP28828 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 6030443J06Rik-203ENSMUST00000181764 4299 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
PtprmP28828 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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PtprmP28828 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Stag1-201ENSMUST00000041418 5909 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
PtprmP28828 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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