Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm36928-201ENSMUST00000192466 694 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm37325-201ENSMUST00000194971 694 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxrgP28705 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
RxrgP28705 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms