Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Rps19-ps1-201ENSMUST00000168472 438 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm8407-201ENSMUST00000192719 427 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Abracl-201ENSMUST00000020002 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm30504-203ENSMUST00000209762 1048 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm45549-201ENSMUST00000210180 975 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr503-202ENSMUST00000211693 966 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC126805.1-201ENSMUST00000225142 262 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gkn2-201ENSMUST00000032128 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr503-201ENSMUST00000078162 972 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm26003-201ENSMUST00000083061 113 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr1303-201ENSMUST00000099609 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Scn8a-204ENSMUST00000108909 11436 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Vmn2r92-201ENSMUST00000169686 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm11870-201ENSMUST00000119255 1322 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Fhl1-205ENSMUST00000114773 2298 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 1600012P17Rik-201ENSMUST00000062159 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Sept3-201ENSMUST00000023095 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Nol4-202ENSMUST00000081423 3309 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm45873-201ENSMUST00000211865 1915 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Rtl5-201ENSMUST00000113631 4653 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm12648-201ENSMUST00000126270 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm14170-201ENSMUST00000133751 331 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm26351-201ENSMUST00000157532 232 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Mir6999-201ENSMUST00000183498 61 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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