Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm24307-201ENSMUST00000178512 101 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 1700024P04Rik-201ENSMUST00000054425 481 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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TtrP07309 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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TtrP07309 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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TtrP07309 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TtrP07309 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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TtrP07309 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TtrP07309 Trim40-203ENSMUST00000172711 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TtrP07309 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TtrP07309 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TtrP07309 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TtrP07309 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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TtrP07309 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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TtrP07309 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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TtrP07309 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TtrP07309 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TtrP07309 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TtrP07309 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TtrP07309 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TtrP07309 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TtrP07309 Mrpl22-201ENSMUST00000020820 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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