Protein–RNA interactions for Protein: J3QME2

Gm20914, Predicted gene, 20914, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20914J3QME2 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20914J3QME2 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms