Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Mrpl42-201ENSMUST00000075829 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm3550W4VSN7 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Gm3550W4VSN7 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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