Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr1410-202ENSMUST00000216553 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Nos1-202ENSMUST00000102557 4591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Unc45b-202ENSMUST00000108160 4152 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Sf3b3-201ENSMUST00000042012 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Rreb1-201ENSMUST00000037232 8395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Kif5a-202ENSMUST00000217895 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm3841-201ENSMUST00000191399 451 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Abce1-201ENSMUST00000080536 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Diaph1-203ENSMUST00000115629 5416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Adam22-206ENSMUST00000115386 9056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Col5a3Q9JLI2 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
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