Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Usp29Q9ES63 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp29Q9ES63 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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