Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms