Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ccdc187Q8C5V8 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm9866-203ENSMUST00000182592 8487 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ccdc187Q8C5V8 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ccdc187Q8C5V8 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ccdc187Q8C5V8 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ccdc187Q8C5V8 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ccdc187Q8C5V8 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Ccdc187Q8C5V8 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ccdc187Q8C5V8 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Ccdc187Q8C5V8 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc187Q8C5V8 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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