Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm13017-201ENSMUST00000156409 400 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms