Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm43161-201ENSMUST00000197020 1688 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm25761-201ENSMUST00000103983 128 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm25762-201ENSMUST00000103984 132 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm14170-201ENSMUST00000133751 331 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm25266-201ENSMUST00000158521 304 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm25442-201ENSMUST00000177270 92 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm28401-202ENSMUST00000190769 550 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm42667-201ENSMUST00000196132 234 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm5857-201ENSMUST00000198953 493 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm43310-201ENSMUST00000198975 820 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Iglc1-201ENSMUST00000200568 454 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 2310003N18Rik-201ENSMUST00000215655 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 AC129975.2-201ENSMUST00000223705 775 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 AC100209.1-201ENSMUST00000225562 409 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Cxcl5-201ENSMUST00000031318 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Adam2-201ENSMUST00000022618 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 A130023I24Rik-201ENSMUST00000152709 1897 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Olfr467-203ENSMUST00000214253 1855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Tead1-206ENSMUST00000164363 1495 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Mtbp-204ENSMUST00000169667 2570 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 n-R5s1-201ENSMUST00000101925 119 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm2214-201ENSMUST00000121333 330 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 n-R5s76-201ENSMUST00000122700 113 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ubash3bQ8BGG7 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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