Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Dsg1bQ7TSF1 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Zmym5-202ENSMUST00000111285 5351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 CT009515.4-201ENSMUST00000228165 1494 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Dsg1bQ7TSF1 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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