Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm15721-201ENSMUST00000138406 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-212ENSMUST00000111686 6061 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Muc6-203ENSMUST00000190907 8757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Prdm15-201ENSMUST00000095849 6346 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Otud7b-203ENSMUST00000098849 8046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Rnmt-201ENSMUST00000009679 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Prpf4-201ENSMUST00000084524 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm44812-201ENSMUST00000207627 5349 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 BC016579-201ENSMUST00000036732 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm884-202ENSMUST00000167262 4576 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NipblQ6KCD5 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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