Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Myt1-203ENSMUST00000108757 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Sept3-201ENSMUST00000023095 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Tas1r3-201ENSMUST00000030949 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 C78859-201ENSMUST00000212800 5943 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ccdc18Q640L5 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ccdc18Q640L5 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ccdc18Q640L5 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ccdc18Q640L5 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Ccdc18Q640L5 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Entpd5-201ENSMUST00000021662 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccdc18Q640L5 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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