Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AC163660.3-202ENSMUST00000224917 464 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AC158519.1-201ENSMUST00000228615 179 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 6330409D20Rik-201ENSMUST00000009695 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm12253-201ENSMUST00000108825 1356 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gabarap-202ENSMUST00000108592 750 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Wdr61-205ENSMUST00000130368 1162 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 D7Ertd128e-201ENSMUST00000189744 928 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm42794-201ENSMUST00000197636 835 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm44725-201ENSMUST00000205307 391 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Apoc2-201ENSMUST00000003074 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Wdr61-201ENSMUST00000051822 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Rpsa-ps2-201ENSMUST00000059546 880 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Tmem35b-202ENSMUST00000106097 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms