Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Adgrl3-212ENSMUST00000120144 4999 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Khdc1a-201ENSMUST00000088407 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Klhdc9Q3USL1 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms