Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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Ccndbp1Q3TVC7 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Ccndbp1Q3TVC7 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Ccndbp1Q3TVC7 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Ccndbp1Q3TVC7 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Ccndbp1Q3TVC7 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Ccndbp1Q3TVC7 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Ccndbp1Q3TVC7 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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