Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Rpusd3Q14AI6 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Rpusd3Q14AI6 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Rpusd3Q14AI6 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Rpusd3Q14AI6 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Rpusd3Q14AI6 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Rpusd3Q14AI6 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Rpusd3Q14AI6 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Rpusd3Q14AI6 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Rpusd3Q14AI6 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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Rpusd3Q14AI6 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Rpusd3Q14AI6 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rpusd3Q14AI6 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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