Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd13P70217 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Hoxd13P70217 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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Hoxd13P70217 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Hoxd13P70217 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Hoxd13P70217 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Hoxd13P70217 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Hoxd13P70217 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Hoxd13P70217 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Hoxd13P70217 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms