Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Rps29P62274 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 471.8 ms