Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Klf12-205ENSMUST00000228216 5890 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Etl4-205ENSMUST00000114607 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Plagl2-202ENSMUST00000109795 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Ttc26-205ENSMUST00000162554 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Wwp1-202ENSMUST00000108246 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm14252-201ENSMUST00000131801 3215 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Dhx8-201ENSMUST00000039152 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Map3k20-204ENSMUST00000135469 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm20236-201ENSMUST00000193037 4540 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm37094-201ENSMUST00000193352 4540 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprmP28828 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
PtprmP28828 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
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