Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Rbm12-201ENSMUST00000059647 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm44178-201ENSMUST00000205229 2930 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 F10-202ENSMUST00000063820 2503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 D3Ertd751e-207ENSMUST00000146165 3574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm34297-201ENSMUST00000218569 1980 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 4930407I10Rik-201ENSMUST00000100396 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm27048-201ENSMUST00000182891 4627 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Ighj1-201ENSMUST00000103430 53 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Zfp467-207ENSMUST00000114563 463 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm14099-201ENSMUST00000117769 605 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Mcee-204ENSMUST00000206882 391 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm10155-201ENSMUST00000084598 483 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm40309-201ENSMUST00000202699 1752 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 4933402E13Rik-201ENSMUST00000051414 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Ctnnd1-212ENSMUST00000111686 6061 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm2098-201ENSMUST00000189146 1763 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Fam129a-205ENSMUST00000148810 6531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Rps19-ps2-201ENSMUST00000100614 438 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Efcab9-202ENSMUST00000109377 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm12987-201ENSMUST00000118562 489 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Olfr268-ps1-201ENSMUST00000121395 945 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm12517-201ENSMUST00000122082 425 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Hoxd9P28357 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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