Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb2P13373 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms