Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Itgb1P09055 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Itgb1P09055 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms