Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Olfr514-201ENSMUST00000084754 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Tmem35b-202ENSMUST00000106097 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC125074.1-201ENSMUST00000227970 1331 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm24325-201ENSMUST00000175344 74 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Pisrt1-201ENSMUST00000195532 515 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm17978-201ENSMUST00000195986 769 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm43815-201ENSMUST00000197676 990 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Gm32072-201ENSMUST00000200803 1434 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Smim18J3QNP2 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms