Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gtf3c2-210ENSMUST00000202639 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Usf3-202ENSMUST00000119746 12708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprbB2RU80 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms