Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Rrn3B2RS91 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Rrn3B2RS91 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms