Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
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Spocd1B1ASB6 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Spocd1B1ASB6 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
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