Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm8084-201ENSMUST00000120807 752 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ChmQ9QXG2 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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