Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf6Q9DBU5 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnf6Q9DBU5 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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