Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Q9CQC3 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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