Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 AC113031.6-202ENSMUST00000228468 1145 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Lyn-202ENSMUST00000103010 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm43839-201ENSMUST00000196183 2325 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 2600014E21Rik-201ENSMUST00000186411 4805 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Eif2ak4-205ENSMUST00000110872 4907 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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PtprtQ99M80 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Lrrc15-201ENSMUST00000064606 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Olfr52-202ENSMUST00000215138 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm43336-201ENSMUST00000200487 4504 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Egf-202ENSMUST00000197079 3346 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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PtprtQ99M80 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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PtprtQ99M80 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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PtprtQ99M80 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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PtprtQ99M80 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Il1rap-201ENSMUST00000023156 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Fnbp1-207ENSMUST00000113559 4378 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gimap4-201ENSMUST00000067506 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprtQ99M80 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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