Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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Usp11Q99K46 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Usp11Q99K46 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Usp11Q99K46 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Usp11Q99K46 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Usp11Q99K46 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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