Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm9866-203ENSMUST00000182592 8487 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71Q8VEG0 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms