Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Olfr517-201ENSMUST00000084753 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Prpf39Q8K2Z2 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Prpf39Q8K2Z2 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Prpf39Q8K2Z2 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Prpf39Q8K2Z2 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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