Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 H2al1j-201ENSMUST00000091180 330 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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