Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Pcsk9Q80W65 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms