Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Actn1Q7TPR4 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms