Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Atg9bQ6EBV9 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg9bQ6EBV9 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg9bQ6EBV9 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg9bQ6EBV9 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg9bQ6EBV9 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Atg9bQ6EBV9 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg9bQ6EBV9 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg9bQ6EBV9 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Atg9bQ6EBV9 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg9bQ6EBV9 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg9bQ6EBV9 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg9bQ6EBV9 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Atg9bQ6EBV9 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Atg9bQ6EBV9 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg9bQ6EBV9 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg9bQ6EBV9 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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Atg9bQ6EBV9 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Atg9bQ6EBV9 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Atg9bQ6EBV9 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg9bQ6EBV9 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Atg9bQ6EBV9 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Atg9bQ6EBV9 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Atg9bQ6EBV9 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Atg9bQ6EBV9 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atg9bQ6EBV9 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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Atg9bQ6EBV9 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9bQ6EBV9 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9bQ6EBV9 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9bQ6EBV9 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9bQ6EBV9 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9bQ6EBV9 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Atg9bQ6EBV9 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9bQ6EBV9 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9bQ6EBV9 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9bQ6EBV9 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9bQ6EBV9 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9bQ6EBV9 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9bQ6EBV9 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9bQ6EBV9 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9bQ6EBV9 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9bQ6EBV9 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9bQ6EBV9 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9bQ6EBV9 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9bQ6EBV9 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9bQ6EBV9 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9bQ6EBV9 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9bQ6EBV9 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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