Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Ank3-231ENSMUST00000182884 9963 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Pbrm1-204ENSMUST00000090214 6212 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Psme4Q5SSW2 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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Psme4Q5SSW2 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Pogk-203ENSMUST00000131487 8692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Prpf4-201ENSMUST00000084524 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Psme4Q5SSW2 Mars2-201ENSMUST00000061334 11294 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms