Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Olfr400-ps1-201ENSMUST00000118094 955 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm11546-201ENSMUST00000120297 354 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm4473-201ENSMUST00000145987 657 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm37800-201ENSMUST00000192129 664 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm42952-203ENSMUST00000197784 798 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm23927-202ENSMUST00000199928 216 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm43699-201ENSMUST00000201312 818 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Lyzl1-201ENSMUST00000025076 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Olfr418-201ENSMUST00000059754 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm16410-201ENSMUST00000094550 774 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm24335-201ENSMUST00000104211 132 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm22900-201ENSMUST00000104538 130 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm11901-201ENSMUST00000120412 437 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm16556-201ENSMUST00000162608 471 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps7-201ENSMUST00000176244 1098 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Il19-204ENSMUST00000187916 720 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 5031425E22Rik-205ENSMUST00000191186 719 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm8010-201ENSMUST00000194128 873 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 AC137127.2-201ENSMUST00000215086 935 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Sft2d1Q5SSN7 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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