Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Rpsa-ps2-201ENSMUST00000059546 880 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec31aQ3UPL0 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms