Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm10259-201ENSMUST00000091289 1590 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Rsph10b-204ENSMUST00000169758 702 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ttc39dQ0VF76 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.5 ms