Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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Ebf1Q07802 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ebf1Q07802 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Ebf1Q07802 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ebf1Q07802 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ebf1Q07802 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ebf1Q07802 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ebf1Q07802 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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